Fəlsəfə və Elmlər doktoru proqramları üzrə Doktoranturaya qəbulu planlaşdırır və qəbul prosesini həyata keçirir. Doktorant və dissertantların dissertasiya mövzularının Əlaqələndirmə şuralarına göndərilməsi və təsdiq edilməsinə rəhbərlik edir. Doktorant və dissertantların təhsilini təşkil edir, onların attestasiyası və fərdi iş planı üzrə işləməsinə nəzarət edir. Fəlsəfə doktorluğu minimumu imtahanlarının keçirilməsini təşkil edir. Doktorantura şöbəsinin işi haqqında hesabatların tələb olunan orqanlara təqdim olunmasına nəzarət edir.